生息地域限定種
BirdLife Internationalの「Endemic Bird Areas of the World」でRestricted-range speciesとされている、世界的な繁殖分布域が50,000km2未満の種（詳細は日本野鳥の会のIBA選定基準のページを参照）
ミゾゴイ ヤンバルクイナ アマミヤマシギ カラスバト ズアカアオバト リュウキュウコノハズク ノグチゲラ リュウキュウサンショウクイ オオトラツグミ アカコッコ アカヒゲ イイジマムシクイ メグロ ノジコ ルリカケス
日本のIBA選定のためのバイオーム限定種
単にバイオーム限定種とすると、普通種も多数リストアップされるが、ここではBirdLife InternationalのIBA（Important Bird Areas）の日本での選定（詳細は日本野鳥の会のIBA選定基準のページを参照）にあたって選定された、環境との結びつきが強い繁殖種（その種の全世界の繁殖分布域の10%程度以上を日本が占める種で、かつ日本全国の分布域が20%未満（島嶼域を除く）の種）を示す。
緯度森林地帯
- シマセンニュウ
北東アジア温帯林
- オシドリ カヤクグリ サシバ コマドリ ヤマドリ サンコウチョウ イカルチドリ クロジ ケリ コジュリン オオジシギ コムクドリ サンショウクイ
日本特産種
どこまでを特産というかで変わってくるが、以下の種は日本特産種とされることが多いようだ（絶滅種は省略）。
アホウドリ クロウミツバメ ミゾゴイ ヤマドリ ヤンバルクイナ アマミヤマシギ オオジシギ カンムリウミスズメ アオゲラ ノグチゲラ セグロセキレイ カヤクグリ コマドリ アカヒゲ アカコッコ イイジマムシクイ メグロ ノジコ ルリカケス
2009年版：詳細
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