文化財保護法
文化財保護法に基づく天然記念物
地域を定めずに種指定されているものと地域指定のものがある。ここには種指定のものだけをあげた。地域指定のものは重要生息地のページに掲載する予定。
特別天然記念物
アホウドリ コウノトリ トキ カンムリワシ ライチョウ タンチョウ ノグチゲラ メグロ
天然記念物
コクガン マガン ヒシクイ オジロワシ オオワシ (亜種)オガサワラノスリ イヌワシ ヤンバルクイナ カンムリウミスズメ (亜種)アカガシラカラスバト (亜種)カラスバト (亜種)リュウキュウキンバト (亜種)エゾシマフクロウ クマゲラ (亜種)オーストンオオアカゲラ アカヒゲ (亜種)オオトラツグミ アカコッコ イイジマムシクイ ルリカケス
種の保存法
絶滅のおそれのある野生動植物の種の保存に関する法律に基づく希少野生動植物種
国内希少野生動植物種には、以前特殊鳥類とされていた種がほとんどそのまま移行し、その後北海道での繁殖が確認されたワシミミズクが緊急指定種を経て加わっている。
国内希少野生動植物種
アホウドリ／ チシマウガラス／ コウノトリ／ トキ／ シジュウカラガン／ オジロワシ／ オオワシ／ オオタカ (亜種)オガサワラノスリ (亜種)ダイトウノスリ／ クマタカ／ イヌワシ／ カンムリワシ (亜種)シマハヤブサ (亜種)ハヤブサ／ ライチョウ／ タンチョウ／ ヤンバルクイナ／ カラフトアオアシシギ／ アマミヤマシギ／ ウミガラス／ エトピリカ (亜種)アカガシラカラスバト／ キンバト／ ワシミミズク／ シマフクロウ／ ノグチゲラ (亜種)オーストンオオアカゲラ／ ミユビゲラ／ ヤイロチョウ／ アカヒゲ (亜種)オオトラツグミ／ オオセッカ／ メグロ (亜種)オガサワラカワラヒワ／ ルリカケス
緊急指定種
現時点ではなし（一時ワシミミズクが該当したが、検討後国内希少野生動植物種に加えられた）
国際希少野生動植物種
コウライアイサ ナベヅル マナヅル ソデグロヅル シロハラチュウシャクシギ コシャクシギ コアジサシ
鳥獣保護法
鳥獣の保護及び狩猟の適正化に関する法律基づく希少鳥獣
特に保護を図る必要のある鳥獣を「希少鳥獣」と規定している（レッドリストで絶滅危惧I類・II類に該当する種が基本）。平成14年に決められたものの改訂が予定されている（パブコメ中：平成20年8月）。
改訂前
ミズナギドリ目
- アホウドリ コアホウドリ シロハラミズナギドリ ヒメクロウミツバメ クロコシジロウミツバメ オーストンウミツバメ クロウミツバメ
ペリカン目
- アカオネッタイチョウ アオツラカツオドリ アカアシカツオドリ チシマウガラス
コウノトリ目
- サンカノゴイ オオヨシゴイ コウノトリ クロツラヘラサギ トキ
カモ目
- シジュウカラガン コクガン ヒシクイ ツクシガモ トモエガモ
タカ目
- オジロワシ オオワシ オオタカ (亜種)リュウキュウツミ (亜種)オガサワラノスリ (亜種)ダイトウノスリ クマタカ イヌワシ カンムリワシ チュウヒ (亜種)ハヤブサ (亜種)シマハヤブサ
キジ目
- ライチョウ
ツル目
- タンチョウ ナベヅル マナヅル ヤンバルクイナ オオクイナ シマクイナ
チドリ目
- チシマシギ ヘラシギ アカアシシギ カラフトアオアシシギ ホウロクシギ コシャクシギ アマミヤマシギ セイタカシギ ツバメチドリ ズグロカモメ オオアジサシ コアジサシ ウミガラス ケイマフリ ウミスズメ カンムリウミスズメ エトピリカ
ハト目
- (亜種)アカガシラカラスバト (亜種)ヨナクニカラスバト シラコバト キンバト
フクロウ目
- ワシミミズク シマフクロウ (亜種)リュウキュウオオコノハズク キンメフクロウ
ブッポウソウ目
- ブッポウソウ
キツツキ目
- ノグチゲラ クマゲラ (亜種)オーストンオオアカゲラ (亜種)アマミコゲラ ミユビゲラ
スズメ目
- ヤイロチョウ サンショウクイ チゴモズ (亜種)モスケミソサザイ (亜種)タネコマドリ (亜種)アカヒゲ (亜種)ホントウアカヒゲ (亜種)ウスアカヒゲ (亜種)オオトラツグミ アカコッコ オオセッカ (亜種)ウチヤマシマセンニュウ イイジマムシクイ (亜種)ナミエヤマガラ (亜種)オーストンヤマガラ (亜種)オリイヤマガラ (亜種)ハハジマメグロ コジュリン (亜種)オガサワラカワラヒワ ルリカケス
改訂で追加される予定のもの
ヒメウ ミゾゴイ ズグロミゾゴイ サシバ ヒクイナ ベニアジサシ ヨタカ アカモズ シマアオジ
改訂で除外される予定のもの
シロハラミズナギドリ チシマシギ (亜種)アマミコゲラ (亜種)オリイヤマガラ ルリカケス
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