赤、緑はポケモンの出現率以外違いはなかったが、
青はポケモンの出現率の違いの他に、
・全ポケモンのグラフィック、図鑑のテキスト
・一部のダンジョンマップ
・一部のポケモンの出現時レベル
・ストーリー上で交換してくれるポケモン
が異なっている。
とは言うものの、ほとんど赤、緑と変わらないと感じるはずだ。
＜青で入手できないポケモン＞
アーボ、アーボック、ロコン、キュウコン、マンキー、オコリザル、マダツボミ、ウツドン、ウツボット、
エレブー、ブーバー（赤、緑を折半した感じ）
また赤、緑と同じく、ヒトカゲ、ゼニガメ、フシギダネは最初にどれか１匹を選ぶことになるし（選ばなかったのは進化系を含み入手できない）、
ゲンガー、フーディン、カイリキー、ゴローニャは通信交換しないと入手できません。
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