カラー魚拓には、直接法と間接法があります。

直接法は文字どおり直接魚に色を付け、その上に拓紙を載せて写し取ります。一般的な墨による魚拓と同じ方法です。

間接法は魚の上に拓紙を載せてから、色を付けます。
魚には色が付きませんので、後からご馳走になれます。
私の作品はほとんどが間接法によるものです。

間接法について簡単に説明します。
１．魚のぬめりをしっかり取ります。
２．薄い和紙、画仙紙を魚に貼り付けます。
３．綿を絹でくるんだタンポに絵の具を付けて
　　軽く色を付けます。
詳しい説明がこちらにあります。
私の先生のＨＰです。
http://fukuchin.com/myhp/omise/gyotaku/taku_s0.htm

基本ができれば、決して難しくありません。
ぜひチャレンジしてみてください。